潔淨室在製藥業有著廣泛的應用。

醫藥生產：生物製藥無塵室污染控制：污染源控制、傳播過程控制、交叉污染控制。

藥品生產環境提出了與工藝流程相對應的不同潔淨度要求，針對原料藥製備、粉劑、注射劑、片劑、大輸液生產、灌裝等工藝，制定了潔淨區和控制區的潔淨度標準。

潔淨室藥品的關鍵技術主要是控製粉塵和微生物。微生物作為污染物，是無塵室最重要的環境控制。藥廠潔淨區內的設備、管道等可直接污染藥品，但不影響潔淨度測試。因此我們說：GMP要求空氣淨化技術，而空氣淨化技術並不意味著潔淨度等級不適用。空氣淨化技術表徵懸浮微粒的物理、化學、放射學和生命徵象。

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GMP，全名為（GOOD MANUFACTURING PRACTICES），中文意義為「生產品質管理規範」或「良好操作規範」、「良好生產標準」。 GMP是一套適用於製藥、食品等行業的強制性標準，要求企業依照國家相關規定，在原料、人員、設施設備、生產流程、包裝運輸、品質管制等方面達到衛生品質要求。此操作規範有助於企業改善企業衛生環境，發現生產過程中的問題，並加以改善。簡而言之，GMP要求製藥、食品等生產企業擁有良好的生產設備、合理的生產流程、完善的品質管理和嚴格的檢測體系，以確保最終產品品質（包括食品安全衛生）符合法規的要求。