手術室的氣壓依不同區域（如手術室、無菌準備室、刷手室、麻醉室、週邊潔淨區等）的無塵度要求而有所不同。不同等級的層流手術室，其空氣潔淨度標準也有所不同。例如，美國聯邦標準1000級為每立方英尺空氣中≥0.5μm的塵埃粒子數，≤1000粒或每公升空氣中≤35粒。 10000級的標準 層流手術室 是指每立方英尺空氣中≥0.5μm的塵埃粒子數、≤10000粒或每公升空氣中≤350粒。等等。手術室通風的主要目的是排除各工作室的廢氣；保證各工作室必要的新鮮空氣量；去除灰塵和微生物；維持房間內必要的正壓。

有以下兩種機械通風方式可以滿足手術室的通風要求。機械送風與機械排氣合併使用：此種通風方式可控制換氣次數、換氣量及室內壓力，通風效果較佳。機械送風與自然排氣合併使用，此種通風方式的換氣量及換氣次數受到一定限制，通風效果不如前者。手術室潔淨度等級主要以空氣中的塵埃粒子數和生物粒子數來區分，目前最常用的是NASA分類標準。淨化技術透過控制正壓淨化氣流的潔淨度來達到無菌的目的。

依送風方式不同，淨化技術可分為湍流系統及層流系統兩大類。

（1）亂流系統（多向式）：亂流系統的送風口和高效過濾器設在天花板，回風口設在兩側或牆面下部，過濾器和空氣處理比較簡單，擴充方便，成本較低，但換氣次數較少，一般為10～50次/h，易產生渦流。污染物顆粒可能在室內渦流區懸浮循環，形成污染氣流，降低室內淨化程度。只適用於NASA標準中10000～1000000級的無塵室。

（2） 層流系統 ：層流系統利用均勻分佈、適當流速的氣流，將粒狀物及粉塵經由回風口帶出手術室，不產生渦流，因此無浮塵，淨化程度可隨風量變化。送風頻率隨風量增加而增加，適用於美國NASA標準的百級手術室。但過濾器密封破損率較大，成本較高。