手術室的氣壓依不同區域（如手術室、無菌準備室、刷手室、麻醉室、周圍潔淨區等）的無塵度要求而不同。不同等級的層流手術室有不同的空氣潔淨度標準。例如，美國聯邦標準1000是指每立方英尺空氣中≥0.5μm的塵埃粒子數、每公升空氣中≤1000個粒子或≤35個粒子。萬級層流手術室標準是指每立方英尺空氣中≥0.5μm、≤10,000 個顆粒或每公升空氣中≤350 個顆粒的數量。等等。手術室通風的主要目的是消除各工作室的廢氣；確保各工作室有必要的新鮮空氣量；去除灰塵和微生物；以維持房間內必要的正壓。

有以下兩種機械通風方式可以滿足手術室的通風要求。機械送風和機械排氣結合使用：這種通風方式可以控制換氣次數、換氣量和室內壓力，通風效果較好。機械送風和自然排風並用。這種通風方式的換氣量和換氣次數受到一定程度的限制，通風效果不如前者。手術室的潔淨度等級主要透過空氣中的塵埃顆粒數和生物顆粒數來區分。目前，最常用的是NASA分類標準。

依送風方式的不同，淨化技術可分為湍流系統和層流系統兩種。

（1）湍流系統（多向方式）：湍流系統的送風口和高效率過濾器位於天花板上，回風口位於兩側或牆體下部。過濾器和空氣處理比較簡單，擴展方便。，成本低，但換氣次數少，一般為10-50次/h，易產生渦流。污染物顆粒可能在室內渦流區懸浮循環，形成污染氣流，降低室內淨化效果。僅適用於NASA標準中的10 000級至1000 000級無塵室。

(2)層流系統：層流系統採用分佈均勻、流量適當的氣流，將顆粒、粉塵經由回風口帶出手術室，不產生渦流，因此不存在浮塵，淨化程度可以改變。送風頻率隨增加而增加，適合美國NASA標準的100級手術室。但過濾器密封件損壞率較大，成本較高。